Wykład monograficzny - Metody analizy genomów 320-BS2-2WM08
Wykład (WYK) Rok akademicki 2020/21

Literatura podstawowa:

1. Brown TA. Genomy. Nowe wydanie. 2013. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa.

2. Aktualne pozycje literaturowe (najnowsze publikacje).

Literatura uzupełniająca:

2. Bal J. Biologia molekularna w medycynie. Elementy genetyki klinicznej. 2013. Wydawnictwo Naukowe PWN. Warszawa. (rozdział VI.: Metody analizy genomu, s. 89-136).

3. Higgs PG, Attwood TK. 2008. Bioinformatyka i ewolucja molekularna. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa. (rozdział 12.: Ewolucja genomu, s. 414-450).

1. Student wyjaśnia cechy i rodzaje genomów oraz zna metody ich analizy. (KA7_WG2, KA7_WG6)

2. Student identyfikuje geny w genomach, zna sposoby poznania genomu człowieka i innych organizmów (KA7_WG2, KA7_WG6)

3. Posługując się odpowiednim oprogramowaniem oraz zestawami sekwencji DNA genomu mitochondrialnego student analizuje polimorfizmy w genomach i identyfikuje miejsca poddane działaniu selekcji (KA7_WG6, KA7_UW)

4. Student jest świadomy możliwości badawczych i aplikacyjnych, jakie dają narzędzia do analizy genomów. (KA7_WG7)

Sposoby weryfikacji efektów uczenia się:

- test pisemny, pytania otwarte i zamknięte.

Zaliczenie pisemne, pytania otwarte i zamknięte.

Kryteria oceny pisemnych prac zaliczeniowych zgodnie z kryteriami określonymi w §23 ust. 6 Regulaminu Studiów Uniwersytetu w

Białymstoku przyjętego Uchwałą nr 2527 Senatu Uniwersytetu w Białymstoku z dnia 26 czerwca 2019 roku.

1. Genomy – definicje, rodzaje i podstawowe fakty.

2. Współczesne metody i narzędzia powielania, analizy i znakowania DNA.

3. Metody i aparatura do sekwencjonowania genomów.

4. Metody składania i analizy sekwencji całych genomów.

5. Identyfikacja i analiza polimorfizmów w genomach.

6. Metody identyfikacji, ustalania funkcji, lokalizacji i mapowania genów w genomach. Mapy genetyczne i fizyczne.

7. Genomy cytoplazmatyczne (mitochondrialny i chloroplastowy) oraz metody ich analiz.

8. Projekt poznania genomu człowieka (HGP).

9. Wybrane projekty poznania genomów różnych organizmów.

10. Internetowe bazy danych do analiz genomowych.

11. Podstawowe informacje nt. badań transktyptomów, proteomów, metabolomów oraz metylomów.

12. Ewolucja genomów.

13. Genomika porównawcza oraz genomika funkcjonalna

Wykład, wykład problemowy,

animacje z Intranetu, platformy do analiz genomowych on-line.

wykład, konsultacje, demonstracja (podczas wykładu) działania wybranych aplikacji/programów do analizy genomowych sekwencji DNA.