Techniki molekularne 320-MS1-1TMO
Laboratorium (LAB) Rok akademicki 2023/24

Literatura podstawowa:

1. Baj J., Markiewicz Z. (red.). 2015. Biologia molekularna bakterii. PWN, Warszawa.

2. Avise J.C. 2008. Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja. Wydawnictwo UW.

3. Słomski R. (red.). 2011. Analiza DNA: teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu.

4. Węgleński P. (red). 2018. Genetyka molekularna. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa.

Literatura uzupełniająca:

5. Jakubowocz T. (red.). 1999. Ćwiczenia z biologii molekularnej. Lublin, Wydawnictwo Uniwersytetu Marii Curie-Skłodowskiej.

Wiedza:

1. Student zna podstawowe metody badawcze i analityczne stosowane w laboratoriach mikrobiologicznych (KP6_WG6).

Umiejętności:

2. Student potrafi przeprowadzić podstawowe analizy mikrobiologiczne wymagające zastosowania metod molekularnych oraz udokumentować uzyskane wyniki (KP6_UW1).

3. Student zna i stosuje prawidłowe zasady bezpiecznej i higienicznej pracy w laboratorium mikrobiologicznym i biologii molekularnej oraz stosuje zasady dobrej praktyki laboratoryjnej (KP6_UO1).

4. Student pracuje skutecznie w zespołach rozwiązując problemy wymagające stosowania zasad z zakresu technik molekularnych (KP6_UO2).

Kompetencje społeczne:

5. Student jest gotów zarówno do krytycznej swojej wiedzy i umiejętności, jak i dostępnych treści w oparciu o specjalistyczne źródła informacji naukowej (KP6_KK2).

Sposoby weryfikacji efektów uczenia się:

KP6_WG6, KP6_UO1 - zaliczenie w formie testu

Warunkiem zaliczenia laboratorium jest obecność na zajęciach (dopuszcza się jedną nieobecność na zajęciach) oraz pozytywna ocena z testu pisemnego (pytania z odpowiedziami do wyboru).

Kryteria ocen zgodnie z kryteriami określonymi w §23 ust. 6 Regulaminu studiów UwB przyjętego Uchwałą nr 2527 Senatu UwB z dnia 26 czerwca 2019 r.

1. Organizacja pracy. Przepisy BHP. Zasady działania laboratoriów molekularnych. Techniki pipetowania.

2. Pobieranie materiału genetycznego, zabezpieczenie i przewożenie. Izolacja oraz pomiar ilości i jakości kwasów nukleinowych (DNA/RNA).

3. Reakcja PCR i jej odmiany.

4. Enzymy restrykcyjne. PCR-RFLP.

5. Oczyszczanie produktów reakcji PCR. Reakcja sekwencjonowania.

6. Oczyszczanie produktów reakcji sekwencjonowania oraz ich rozdział na sekwenatorze kapilarnym.

7. Przyrównanie sekwencji nukleotydowych. Analiza zmienności sekwencji nukleotydowych. Konstrukcja drzew filogenetycznych (zajęcia w sali komputerowej)

8. Bazy danych z zakresu biologii molekularnej. Identyfikacja gatunkowa bakterii w oparciu o 16S rRNA (zajęcia w sali komputerowej)

9. Klonowanie in-silico.

10. Diagnostyka mikroorganizmów w oparciu o system MLST.

11. Pomiar ilościowy i analiza protein.

Metoda laboratoryjna, konsultacje.